Myšlenka fylogeneze se používá v kontextu biologie, aby se zmiňovala o vzniku a vývoji druhu . Koncept může také odkazovat na odvětví této vědy, která se zaměřuje na příbuzné vazby, které existují mezi různými soubory živých bytostí.

Z teorie evoluce řízené anglickým vědcem Charlesm Darwinem bylo nutné znát evoluční historii každého druhu. Fylogeneze se objevila s cílem studovat evoluční vztahy a analyzovat, jak jsou rozlišovány znaky různých taxonů.

Tyto údaje umožňují vytvoření fylogenetických stromů, které podrobně popisují evoluční vztahy mezi druhy, které mají společné předky. Fylogenetické stromy naopak umožňují rozvinout fylogenetickou klasifikaci, která vytváří evoluční blízkost mezi druhy.

Abychom poznali fylogenezi organismu, musíme studovat jeho DNA, její anatomii a její morfologii, mezi mnoha dalšími charakteristikami. Výsledky tohoto druhu studie nám umožňují znát podobnosti a rozdíly mezi jednotlivými druhy, a tak stanovit jejich evoluční vztahy.

Kláda je skupina složená z předka a všech jeho potomků. Také nazývaná monofylitická skupina, se skládá ze společného předka ( království, druh nebo populace) a všech organismů, které z něho sestupují. Pokud je tato skupina vyloučena z potomka, nazývá se paraphyletickou skupinou . Mezitím jsou skupiny složené z druhů, které sestupují z více než jednoho předka, známé jako polyfylétické .